vmd制图怎么改变不同分子的显示

发布网友

我来回答

1个回答

热心网友

首先是需要用来着色的轨迹文件,单帧或多帧的都行,文件名为mp.pdb 这里要说明一下:文件名的后缀必须是VMD能识别的,建议使用pdb格式或xyz格式的(VMD默认就能打开的格式)。
打开VMD,成功导入轨迹文件或分子文件,VMD main窗口,file?save coordinatesSelected atoms 选择 all;File type选择 pdb,或xyz。Frames下面用默认的就行。格式转换后的文件存在VMD的安装主目录下。
其次为用于给原子着色的数据文件,就是想让原子按哪些数值显示颜色,命名为user.data 数据文件的名字无所谓,但其格式有要求,数据文件里的数值只有单一的一列,而且从第一个值到最后一个值必须与轨迹文件中的原子一一对应,数值之间不能空行。</ol>

声明声明:本网页内容为用户发布,旨在传播知识,不代表本网认同其观点,若有侵权等问题请及时与本网联系,我们将在第一时间删除处理。E-MAIL:11247931@qq.com