可根据geo数据分析基因表达变化的软件有哪些

发布网友 发布时间:2022-04-26 02:12

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热心网友 时间:2022-06-19 22:55

将基因表达谱芯片的数据按照指定的格式和要求上传到NCBI 的GEO Datesets 上面的方法
你到GEO上注册,然后按照他们的步骤做,他们会有人联系你来确保数据质量的 。格式等直接问他们就可以。通常是SOFT格式。
GEO Database
近年来,利用高通量方法检测基因表达越来越普及,诸如微阵列杂交和基因表系列分析(SAGE)可以同时测量数以万计的基因转录脚本(gene transcript)。基因表达大棚车(GEO:Gene Expression Omnibus)则是归档和自由分发科研人员提交的高通量基因表达数据的公共仓库。目前,GEO存储了大约10亿单个基因表达的数据,来自于100多种生物,内容广泛涉及到各种生物学问题。这些大容量的数据可以使用用户友好的以Web为基础的工具进行有效的挖掘,检索和可视化表达。

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