天花粉传统的服用方法是水煎服；近代有把天花粉打成细末用水送服的。因天花粉性凉，经常吃可引起脾胃虚寒及大便滑泄的症状。
除此之外，临床应用本品，单独注射天花粉蛋白制剂，还可能出现发热、头痛、皮疹、咽喉痛，颈项活动不利等。偶见神经性血管性水肿，血压下降，心率异常肝脾肿大量出血等。
天花粉毒副作用实验
给小鼠皮下注射原汁冰干天花粉、天花粉蛋白粗制剂、透析天花粉蛋白、结晶天花粉蛋白后，观察10天，其半数致死量分别为：2.26mg/只、0.6mg/只、0.29mg/只、0.236mg/只。
天花粉有毒吗
根据上述实验，我们不难知道，天花粉具有轻微的毒性，也因此，少数病人在注射天花粉蛋白质制剂时会出现多种副作用，但这种毒性较低，常规剂量不会致死。
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天花粉禁止重复使用天花粉蛋白有较强的抗原性，用其给小鼠或豚鼠致敏后，再次给药可呈现过敏反应甚至死亡。临床上有皮试阴性而使用天花粉引产发生过敏的病例，提示重复使用天花粉制剂时需要慎重，第二次引产时最好不用。
天花粉的禁忌
①《本草经集注》："枸杞为之使。恶干姜。畏牛膝、干漆。反乌头。"
②《本草经疏》："脾胃虚寒作泄者勿服。"
③《本草汇言》："汗下之后，亡液而作渴者不可妄投；阴虚火动，津液不能上承而作渴者，不可概施。"
④《本经逢原》："凡痰饮色勺清稀者，忌用。"
⑤《得配本草》："胃虚湿痰，亡阳作渴，病在表者禁用。"