法律分析：法院判决赔偿款医药费应当扣除。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百九十九条 当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以向上一级人民法院申请再审；当事人一方人数众多或者当事人双方为公民的案件，也可以向原审人民法院申请再审。当事人申请再审的，不停止判决、裁定的执行。
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