农村征地房屋补偿存在的问题：
1.农村土地征用和补偿程序不规范；
2.征地补偿标准偏低，补偿费用分配不公；
3.土地补偿资金管理不严，截留、挪用、克扣等现象较为突出；
4.失地农民得不到妥善安置或足够的补偿。
一、征地补偿款村集体可不可以截留
依据土地管理法的规定，征收集体土地时，农村集体是不能对征地补偿款进行截留的，截留征地补偿款在承担相应的法律责任。
《中华人民共和国土地管理法》第四十八条征地补偿安置方案确定后，有关地方人民政府应当公告，并听取被征地的农村集体经济组织和农民的意见。
第四十九条被征地的农村集体经济组织应当将征收土地的补偿费用的收支状况向本集体经济组织的成员公布，接受监督。
禁止侵占、挪用被征收土地单位的征地补偿费用和其他有关费用。
二、四川征地补偿新标准
四川省政府近日转发了四川省国土资源厅《关于规范和调整征地补偿安置标准有关问题的意见》，规定按人均耕地多少确定补偿安置倍数。该《意见》规定，除国家有明确规定的外，全省所有征地的土地补偿费和安置补助费的倍数一律按以下标准执行：
1、人均耕地在1亩及1亩以上的，土地补偿费和安置补助费之和不低于征用耕地前三年种植业的平均年产值的10倍；人均耕地每减少0.1亩其两项补偿费倍数相应增加3倍，但两项补偿费倍数之和不超过30倍。
2、征用耕地前三年种植业的平均年产值以统计部门调查公布的数额为准，任何单位和个人不得擅自更改。对交通能源、大型水利、水电等项目建设用地，所在市、县的统计、国土资源和农业部门应对被征土地的产值进行实地调查，不得使用全县的平均年产值数据。今后凡征用土地都必须根据《集体土地所有证》进行权属调查，确定集体土地权属，确保农村集体土地权益不受侵犯。征地面积必须由有资质的测量单位进行实地测量，制作勘测定界图。
城(镇)规划区范围内的土地应进行城镇地籍测量，以确保被征土地面积准确无误。农用地、建设用地、未利用地三大地类应以规划基期年为准。决不允许在征地时将耕地、园地、养殖水面等归类为其他土地。青苗及附着物补偿标准每五年修订一次，由各市(州)政府报省政府审核批准后执行。
3、在市(州)、县(市、区)政府征地方案依法批准后，要在10个工作日内将征地批准机关、批准文号，征用土地的用途、范围、面积，征地补偿标准，农业人员安置办法，办理征地补偿的期限等，在被征地的所在乡(镇)、村予以公告。被征地的农村集体经济组织、农民和其他权利人应当在征用土地公告规定的期限内办理征地补偿登记手续。
4、征地补偿将由市(州)、县(市、区)国土资源部门直接支付给被征地的农村集体经济组织，避免中间环节截留。土地补偿费属农村集体经济组织所有的，乡镇等其他任何单位不得截留或变相截留。土地补偿费要纳入公积金管理，用于被征地农民参保、发展生产、公益性建设，不得平分到户，也不得列为集体经济债务清欠资金，实行专款专用并接受财政和审计部门的监管。
三、国家怎么征收土地?
1.征用土地一般是土地征收，是指国家为了公共利益需要，依照法律规定的程序和权限将农民集体所有的土地转化为国有土地，并依法给予被征地的农村集体经济组织和被征地农民合理补偿和妥善安置的法律行为。
2.征用土地的程序根据《土地管理法实施条例》第二十五条规定，征收土地方案经依法批准后，由被征收土地所在地的市、县人民政府组织实施，并将批准征地机关、批准文号、征收土地的用途、范围、面积以及征地补偿标准、农业人员安置办法和办理征地补偿的期限等，在被征收土地所在地的乡（镇）、村予以公告。被征收土地的所有权人、使用权人应当在公告规定的期限内，持土地权属证书到公告指定的人民政府土地行政主管部门办理征地补偿登记。
3.市、县人民政府土地行政主管部门根据经批准的征收土地方案，会同有关部门拟订征地补偿、安置方案，在被征收土地所在地的乡（镇）、村予以公告，听取被征收土地的农村集体经济组织和农民的意见。征地补偿、安置方案报市、县人民政府批准后，由市、县人民政府土地行政主管部门组织实施。对补偿标准有争议的，由县级以上地方人民政府协调；协调不成的，由批准征收土地的人民政府裁决。征地补偿、安置争议不影响征收土地方案的实施。
4.征收土地的各项费用应当自征地补偿、安置方案批准之日起3个月内全额支付。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国土地管理法》第四十八条，征地补偿安置方案确定后，有关地方人民政府应当公告，并听取被征地的农村集体经济组织和农民的意见。
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