名词解释汇总
1. 分子杂交
不同的DNA 片段之间,DNA 片段与RNA 片段之间,如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性,形成新的双螺旋结构。这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交。
2. cDNA文库
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。
3. 选择标记基因
选择基因(又称选择标记基因),主要是一类编码可使抗生素或除草剂失活的蛋白酶基因,这种基因在执行其选择功能时,通常存在检测慢(蛋白酶作用需要时间)、依赖外界筛选压力(如抗生素、除草剂)等缺陷。
4. ORF
开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)从起始密码子开始,是DNA序列中具有编
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码蛋白质潜能,一段无终止密码子打断的碱基序列。
5. 转化
转化(transformation)是某一基因型的细胞从周围介质中吸收来自另一基因型的细胞的DNA而使它的基因型和表现型发生相应变化的现象。该现象首先发现于细菌。
6. 转染
专指感受态的大肠杆菌细胞捕获和表达噬菌体DNA分子的过程
7. 转导
转导(transduction)由噬菌体将一个细胞的基因传递给另一细胞的过程。它是细菌之间传递遗传物质的方式之一。其具体含义是指一个细胞的DNA或RNA通过病毒载体的感染转移到另一个细胞中。
8. 质粒不亲和性
在没有选择压力下,两种不一样的质粒不能在同一宿主细胞系中稳定共存的现象
9. RACE
RACE是基于PCR技术基础上由已知的一段cDNA片段,利用锚式PCR,快速扩增cDNA末端从而获得已知mRNA内一段小序列与3‘或5’的cDNA序列技术。
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10. 基因工程
在分子水平上进行遗传操作,指将一种或多种微生物的基因或基因组提取出来,或人工合成基因,按人们的愿望,进行严密的设计,经过体外加工重组,转移到另一种生物体的细胞中,使之能在受体细胞遗传并获得新的遗传性状的技术
11. RT-PCR
mRNA在逆转录酶的作用下得到cDNA第一链,让后直接以其为模板,用特定引物进行PCR的技术
12. 插入失活
载体的标记基因常常含有一个或多个限制酶酶切位点,若用限制酶去处理这些位点并插入一段外源基因,该位点处基因出现无法正常表达的现象成为插入失活
13. SD序列
mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。SD序列在细菌mRNA起始密码子AUG上游7-12个核苷酸处,有一段富含嘌呤的碱基序列,能与细菌16SrRNA的3’端识别,帮助从起始AUG处开始翻译。
14. 穿梭质粒载体
穿梭质粒是指一类具有两种不同复制起点和选择标记,因而可以在两种不同类群宿主中存活和复制的质粒载体。
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15. 多克隆位点(MCS)
载体上人工合成的含有多个限制酶酶切位点的DNA片段
16. Southern 印迹
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量
17. Western 印迹
western印迹是指将蛋白质样品经 聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,然后转移至到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,然后用抗体通过免疫学反应检测目的蛋白,分析基因的表达程度。
18. Northern 印迹
Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。
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19. Cosmid 载体/黏粒
指带有黏端位点(cos)的质粒。黏粒是由人工构建的含有λ噬菌体DNA的cos序列和质粒复制子的载体。
20. 探针(probe)
探针是一小段单链DNA或者RNA片段(大约是20到500bp),用于检测与其互补的核酸序列。
21. Tm
DAN变性温度,加热DNA溶液,使其对260nm紫外线吸光度突然增加,达到最大值一半时的温度
22. DNA 变性
DNA变性是指核酸双螺旋碱基对的氢键断裂,双链变成单链,从而使核酸的天然构象和性质发生改变。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构的改变。
23. DNA复性
DNA的复性指变性DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。热变性DNA一般经缓慢冷却后即可复性,此过程称之为\" 退火\"(annealing)。
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24. 分子杂交
不同的DNA 片段之间,DNA 片段与RNA 片段之间,如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性,形成新的双螺旋结构。这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交。
25. 操纵子
操纵子(operon):指启动基因、操纵基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。
26. 启动子
启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。
27. 增强子
增强子(enhancer)指增加同它连锁的基因转录频率的DNA序列。
28. ρ因子
ρ因子 ρfactor 为存在于大肠杆菌中的,在遗传信息转录的终止阶段起作用的蛋白性因子。
29. 粘性末端
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被限制酶切开的DNA两条单链的切口,带有几个伸出的核苷酸,它们之间正好互补配对,这样的切口叫黏性末端。
30. 平末端
当限制酶从识别序列的中心轴线处切开时,切开的DNA两条单链的切口,是平整的,这样的切口叫平末端
31. DNA连杆
32. DNA接头
一段短的含酶切位点并能与钝性末端或粘性末端匹配的人工合成DNA片段。
33. cDNA
为具有与某mRNA(信使RNA)链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链。
34. 感受态
细胞能够从周围环境中摄取DNA分子,并且不易被细胞内的限制性核酸内切酶分解时所处的一种特殊生理状态称感受态
35. 转换子
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36. 蓝白斑筛选
蓝白斑筛选是一种基因工程常用的细菌重组子的筛选方法。野生型大肠杆菌(E.Coli)产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。5-溴-4-靛蓝可使整个菌落产生蓝色变化。突变型大肠杆菌缺少完整的β-半乳糖苷酶,在含有互补片段质粒作用下,可形成完整的β-半乳糖苷酶,插入外源基因的质粒则破坏了半乳糖苷酶的编码,从而通过颜色变化筛选重组子。
37. 星活性
星活性又称Star活性。是指由于反应条件不同而产生的切断与原来认识序列不同的位点的现象,也就是说产生Star活性后,不但可以切断特异性的识别位点,还可以切断非特异性的位点。产生Star活性的结果是酶切条带增多。
38. 同裂酶
同裂酶的切割位点可能不同,识别序列和切
39. 同尾酶
同尾酶,切割不同的DNA片段但产生相同的粘性末端的一类限制性内切酶。 40. YAC
YAC载体主要是用来构建大片段DNA文库,特别是用来构建高等真核生物的基因组
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文库,并不用作常规的基因克隆。YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个DNA复制起点,两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。
41. 受体细胞
受体细胞是指在转化和转导(感染)中接受外源基因的宿主细胞。
42. 噬菌体表面显示技术
噬菌体展示技术(phage display technology)是将外源蛋白或多肽的DNA序列插入到噬菌体外壳蛋白结构基因的适当位置,使外源基因随外壳蛋白的表达而表达,同时,外源蛋白随噬菌体的重新组装而展示到噬菌体表面的生物技术。
43. 包涵体
在某些生长条件下,大肠杆菌能积累某种特殊的生物大分子,它们致密地集聚在细胞内,或被膜包裹或形成无膜裸露结构,这种水不溶性的结构称为包涵体
44. mRNA差别显示技术
mRNA差别显示技术也称为差示反转录PCR(Differential Display of reverse Transcriptional PCR)简称为ddRT-PCR。它是将mRNA反转录技术与PCR技术二者相互结合发展起来的一种RNA指纹图谱技术。目前已广泛应用于分离鉴定组织特异性表达的基因。差别基因表达(differential gene express)是细胞分化的基础。mRNA差别显
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示技术正是对组织特异性表达的基因进行分离的一种快速而行之有效的方法。该方法的基本原理是首先选取不同的组织样品或不同发育阶段的同一组织样品或同一组织样品经不同药物处理诱导的样品,经总RNA提取后,进行mRNA反转录合成cDNA。此cDNA的合成是采用Oligo(dT)12 MN为引物,其中M为A,C,G中的任意一种,N为A,C,G或T中的任意一种,所以共有12种oligo(dT)12 MN引物,其中M称为锚定碱基,起增大引物Tm值的作用,N称为分类碱基,对反转录进行分类。用这12种引物分别对同一总RNA样品进行cDNA合成,即进行12次不同的反转录反应,从而使反转录的cDNA具有12种类型,也就是对cDNA进行12种归类(目前较为流行的方法是进行4种归类,即M为简并碱基的形式存在),在此基础上对每一类cDNA进行随机引物和反转录引物PCR扩增,通过对组织样品的同一类cDNA的PCR选择性扩增产物凝胶电泳分析,从而反映出不同样品间基因的时间和空间上组织特异性的表达。如此众多种类的mRNA反转录产物经PCR选择扩增后其类型依然为数众多,很难用电泳系统加以快速准确地分离。因而需要对反转录产物cDNA进行归类处理,减轻不同PCR产物电泳分离的难度,提高分离的准确率。
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